Table 2. Wounding experiment

Expression ratio, log10

	WS	WS	WS	*opr3*	*opr3*	*opr3*
Gene	90 min	180 min	360 min	90 min	180 min	360 min

4CL	0.778	0.383	-0.025	0.675	0.225	-0.049
a-TUB	0.089	-0.006	-0.068	0.122	0.042	-0.067
AC1	0.325	0.129	0.042	0.244	0.202	0.070
ACC2	0.151	0.252	-0.122	0.204	-0.053	-0.184
ACO1	0.436	0.640	0.303	0.301	0.218	0.067
ACT	0.101	0.055	0.046	0.034	0.095	0.046
ACX1	0.637	0.654	0.241	0.459	0.401	0.154
ACX1	0.297	0.423	0.093	0.261	0.202	0.015
ACX2	0.053	0.261	0.131	0.025	0.089	-0.099
ADL4	0.010	0.314	0.097	-0.044	0.128	-0.010
AIG1	0.000	0.079	-0.067	0.007	0.094	-0.002
AIG2	0.083	0.145	-0.010	0.053	0.075	0.002
AIM1	-0.049	0.273	0.092	0.058	0.162	0.005
AOS	0.511	0.491	0.162	0.481	0.406	0.089
APX1	0.201	0.258	0.120	0.109	0.151	0.012
AR2	0.033	0.063	0.029	0.016	-0.020	-0.169
ARAB1	0.166	0.213	0.073	0.086	0.177	0.029
ASA1	0.290	0.376	0.006	0.171	0.222	0.023
ASB	0.403	0.346	0.003	0.339	0.125	-0.079
ATER	0.060	0.273	-0.096	0.048	0.074	-0.056
AWI31	0.307	0.558	0.278	0.390	0.330	0.011
b-TUB	0.025	0.084	0.012	0.010	0.040	0.039
CAB (LH1B2)	-0.008	0.001	-0.149	0.094	0.125	-0.049
CAB (LH1B2)	-0.018	0.010	-0.169	0.098	0.156	-0.010
CAD	0.221	0.482	-0.038	0.725	0.630	0.305
CCOAMT	-0.090	0.177	0.033	0.068	-0.086	-0.119
CCR	0.569	0.378	-0.113	0.560	0.442	0.148
CCR1	0.008	0.320	0.054	0.023	0.147	0.095
CHS	0.611	0.295	-0.257	0.426	0.045	-0.093
CM1	0.026	0.146	-0.225	-0.197	-0.326	-0.121
COMT	0.936	0.856	0.142	0.915	0.749	0.275
COR47	0.353	0.322	0.203	0.418	0.209	0.117
COR6.6	0.238	0.248	0.412	0.066	-0.006	0.032
CYP71B6	0.035	0.193	0.059	-0.002	-0.001	-0.104
CYP79B2	0.449	0.595	0.017	0.235	0.147	0.061
CYP83B1	0.541	0.533	0.300	0.115	0.256	0.187
CYP93A1	0.194	0.289	-0.073	0.087	0.220	-0.009
DBP	0.292	0.384	-0.079	0.479	0.372	-0.010
DHS1	0.017	0.039	-0.265	0.138	0.121	-0.157
DREB2A	0.274	0.537	0.217	0.289	-0.002	-0.158
ECS1	-0.089	0.206	0.222	-0.236	0.139	0.249
EF-1	0.009	0.087	-0.018	0.055	0.079	-0.050
EF1a	0.129	0.160	0.012	0.108	0.181	0.027
EH	0.230	0.441	0.068	0.228	0.191	0.032
EIF4A	0.238	0.052	0.048	0.195	0.166	0.018
ELI3	0.064	0.375	0.14	0.019	0.217	0.001

ELI5	0.063	0.150	-0.163	0.236	0.281	-0.137
ELI9	0.066	0.041	0.123	0.034	0.277	0.272
ER5	0.722	0.619	0.353	0.637	0.485	0.272
ERD1	0.561	0.614	0.316	0.347	0.212	0.166
ERD16	0.167	0.357	-0.152	0.146	0.228	0.015
ERD6	0.060	0.248	0.009	0.121	0.112	-0.049
EREC	0.172	0.421	0.057	0.187	0.240	0.051
ERF	0.142	0.348	-0.082	0.144	0.134	-0.095
ERF4	0.317	0.394	0.212	0.399	0.303	0.146
F5H	0.190	0.153	-0.204	0.344	0.168	0.088
FAD2	0.096	0.265	0.162	0.053	0.179	0.085
FAD2	0.022	0.190	0.036	0.066	0.132	-0.091
FAD3	0.095	0.126	-0.178	0.187	0.198	-0.086
FAD7	0.266	0.324	0.083	0.262	0.277	0.010
FPS1	-0.015	0.020	0.037	0.020	-0.040	-0.078
GAD2	0.030	0.307	0.074	0.113	0.205	0.024
GER2	0.024	0.037	-0.134	-0.011	-0.102	-0.167
GF14	0.057	0.245	-0.086	0.172	0.234	0.010
GPX1	0.059	0.194	-0.160	0.284	0.319	0.083
GPX2	0.236	0.527	-0.027	0.385	0.473	0.302
GRP	-0.040	0.137	-0.147	0.000	0.043	-0.124
GS	0.057	0.337	0.123	0.198	0.238	0.097
GSH1	0.035	0.142	-0.056	0.076	0.045	0.025
GST1	0.342	0.497	0.451	0.411	0.318	0.230
GST1	0.323	0.500	0.387	0.290	0.255	0.119
GST5	0.757	0.474	0.419	0.438	0.187	-0.021
GST8	0.139	0.331	0.198	0.114	0.244	0.144
HADH	0.088	0.270	-0.028	0.019	0.066	-0.118
HCNL1	-0.255	-0.162	-0.133	-0.337	-0.197	-0.218
HCNL2	0.057	-0.151	-0.143	0.018	-0.116	-0.016
HEL	-0.045	0.097	0.034	-0.138	-0.045	0.005
HIN1	0.380	0.423	0.070	0.687	-0.045	0.094
HIST	-0.076	-0.038	-0.201	-0.096	0.005	-0.118
HMG1	0.081	0.177	0.091	0.121	0.096	-0.099
HPL	0.404	0.641	0.306	0.219	0.230	0.075
HRGP	-0.014	-0.070	0.027	0.048	0.092	0.085
HSC70	0.273	0.301	0.041	0.228	0.212	0.020
HSC70	0.321	0.177	0.060	0.083	0.134	-0.113
JIP	0.363	0.477	0.102	0.319	0.147	-0.234
JIP	0.350	0.674	0.253	0.249	0.024	-0.183
JR3	0.684	0.800	0.235	0.432	0.244	0.053
JR3	0.869	0.902	0.373	0.418	0.280	0.141
KNAT1	0.115	0.223	-0.043	0.145	0.046	-0.112
LECRK	0.107	0.221	-0.035	0.391	0.048	-0.071
LOX1	0.081	0.089	-0.098	0.269	0.068	-0.156
LOX2	0.224	0.262	0.231	0.267	0.271	0.150
LOX3	0.926	0.811	-0.021	0.785	-0.025	-0.203
LOX4	0.703	0.426	-0.101	0.448	-0.022	-0.164
LTI78	0.315	0.477	0.192	0.332	0.213	0.127
MBP	0.166	0.635	0.090	-0.063	-0.143	-0.139

MEKK1	0.140	0.253	0.035	0.310	0.144	-0.027
MEKKK	0.000	0.000	-0.125	0.000	-0.114	-0.179
MFP2	0.117	0.312	0.115	0.107	0.135	-0.027
MP2C	0.118	0.357	0.008	0.275	0.212	0.007
MPK3	-0.164	0.165	0.058	0.296	0.148	-0.085
MRP2	-0.009	0.072	-0.070	0.127	0.192	0.107
MT1	0.050	0.139	0.065	0.217	0.183	0.078
MYB59	-0.032	0.007	-0.441	0.115	0.234	-0.149
MYB68	-0.057	0.182	-0.281	0.113	0.141	-0.051
MYOL	-0.110	-0.126	-0.215	0.054	-0.104	-0.209
NDK	0.011	0.253	-0.192	0.184	0.183	0.037
NDR1	0.122	0.202	-0.029	0.291	0.171	-0.041
NIT2	0.210	0.601	-0.006	0.298	0.377	-0.022
NPR1	0.095	0.217	0.030	0.311	0.158	-0.059
NR	0.451	0.496	-0.220	0.686	0.436	0.200
OEC	-0.013	0.001	-0.213	0.172	0.107	-0.199
OPR1	0.611	0.740	0.308	0.723	0.587	0.215
OZI1	0.092	0.271	-0.027	0.081	0.177	0.087
PAL	1.087	0.659	-0.086	0.920	0.172	-0.096
PAL1	0.564	0.394	-0.126	0.112	-0.088	-0.176
PAL2	0.839	0.225	-0.171	0.401	-0.032	-0.194
PAL3	0.000	0.000	-0.092	0.077	-0.056	-0.166
PDF1.2	0.116	0.114	-0.121	-0.125	-0.028	0.067
PED1	-0.067	0.421	0.236	-0.012	0.086	0.077
PEL	-0.232	-0.195	-0.139	-0.255	0.004	-0.057
PGIP	0.141	0.293	0.038	0.295	0.210	0.224
PGK	0.016	-0.044	0.000	-0.054	-0.010	-0.047
PIN2	-0.024	0.420	0.289	0.034	0.222	0.138
PIOX	0.217	0.433	0.115	0.196	0.178	0.079
PIR7B	0.099	0.020	-0.199	0.110	0.168	-0.010
PLASTO	-0.009	0.107	-0.191	0.150	0.092	-0.154
PLC1	-0.003	-0.132	-0.124	0.032	-0.090	-0.263
PLC2	0.061	0.211	-0.126	0.071	0.029	-0.120
PLD	-0.004	0.017	-0.053	0.076	0.164	-0.026
PME1	0.246	0.071	-0.038	0.332	0.050	0.013
PR1	-0.060	-0.011	-0.413	-0.401	-0.602	-0.098
PR2	0.008	0.145	-0.215	-0.068	-0.255	-0.068
PR3AIII	0.000	0.036	-0.132	0.000	-0.093	-0.167
PR3AIV	0.184	0.238	0.379	0.214	-0.199	0.087
PR3B1	0.000	0.046	-0.095	0.000	-0.141	0.152
PR5	-0.072	0.061	-0.015	-0.166	-0.315	-0.054
PRK	-0.009	0.072	-0.019	0.017	0.111	0.046
PRODH	0.344	0.368	-0.109	0.415	0.203	0.049
PRX7	0.106	0.157	-0.062	0.180	0.094	0.038
RAB18	0.098	0.466	0.180	0.287	0.201	0.278
RAB1C	0.209	0.410	-0.015	0.272	0.245	0.042
RD19	-0.131	0.313	0.354	-0.037	-0.025	0.104
RD19	-0.363	0.203	0.341	-0.146	-0.036	0.078
RD28	0.411	0.554	0.274	0.377	0.290	0.158
REM2	0.010	0.221	-0.153	0.200	0.141	-0.148

REM3	0.151	0.304	-0.210	0.407	0.201	-0.061
REM5	0.100	0.178	-0.166	0.114	0.012	-0.170
RNS1	0.625	1.372	0.605	0.822	0.844	0.882
RNS2	0.193	0.369	0.011	0.252	0.217	0.013
ROF1	0.034	0.229	-0.069	0.034	0.068	-0.193
RPS11	0.161	0.229	-0.065	0.283	0.214	0.078
RUB	0.007	0.005	-0.053	0.100	0.026	0.017
SAHH	0.260	0.321	-0.115	0.347	0.326	0.005
SAM	0.180	0.371	-0.003	0.294	0.219	-0.049
SODCU	0.306	0.355	0.009	0.202	0.115	0.114
SODFE	0.076	0.135	-0.061	0.169	0.200	-0.006
SPS	-0.192	0.149	-0.004	-0.137	0.074	-0.025
TCH1	0.343	0.381	0.051	0.586	0.295	0.093
TCH2	0.327	0.335	0.036	0.368	0.249	-0.079
TCH3	0.343	0.309	0.283	0.402	0.013	-0.292
TCH4	0.091	0.138	-0.129	0.269	0.093	-0.196
TGG1	0.047	0.101	0.129	0.128	0.212	0.117
TGG2	0.122	0.234	0.101	0.065	0.193	0.112
THI2.1	0.098	0.128	0.009	0.072	-0.050	-0.084
TSA	0.499	0.527	0.207	0.209	0.140	0.000
TSB	0.364	0.455	0.212	0.133	0.164	0.029
TUFA	0.001	-0.019	-0.117	0.028	-0.021	-0.126
UBIQ	-0.090	0.066	0.172	-0.237	-0.097	0.060
VSP	0.815	1.181	0.579	0.079	-0.079	-0.138
XERO2	0.337	0.453	0.034	0.513	0.113	0.066

Arabidopsis leaves from wild-type (WS) or mutant (opr3) plants were wounded and RNA-isolated at different times.

Search:

Directories Site map