Time-course of gene expression after wounding (Figure 2)

Time course experiment: Arabidopsis leaves were wounded and RNA isolated at different times

Expression ratio (log10)

Gene	15 min	30 min	60 min	90 min	3 hr	6 hr	9 hr	24 hr
4CL	-0.151	-0.207	0.126	0.359	0.208	0.091	-0.083	-0.209
a-TUB	0.188	0.030	0.111	0.094	-0.009	-0.173	-0.119	-0.136
ACC2	0.000	0.041	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
ACO1	0.058	0.155	0.082	0.284	0.240	0.065	-0.159	-0.010
ACT	0.096	-0.019	0.070	0.137	0.089	0.038	0.096	-0.070
ACX1	0.268	0.403	0.679	0.785	0.565	0.260	0.203	0.252
ACX2	0.415	0.000	-0.053	0.114	0.296	0.242	0.090	0.230
AIG1	0.096	-0.106	-0.027	-0.026	-0.005	-0.052	0.054	0.006
AIG2	0.311	0.140	0.257	0.261	0.158	0.056	-0.049	0.058
AIM1	-0.040	0.002	-0.202	-0.040	0.077	0.081	0.088	0.224
AOS	0.473	0.560	0.914	0.625	0.375	0.387	0.019	0.141
APX1	0.037	-0.079	0.053	0.117	0.187	0.176	0.201	-0.053
AR2	0.099	-0.435	-0.160	-0.059	0.065	-0.101	-0.123	-0.130
ARAB1	0.082	0.000	-0.308	-0.064	0.096	0.047	0.043	0.072
ASA1	0.277	0.117	0.572	0.419	0.357	0.077	-0.085	-0.161
ASB	0.103	0.116	0.324	0.309	0.304	-0.083	-0.084	-0.082
AWI31	0.090	0.026	0.140	0.478	0.665	0.344	0.185	0.065
b-TUB	0.107	-0.024	0.032	0.000	0.047	-0.157	-0.076	-0.130
CAB	-0.003	-0.021	-0.021	-0.038	-0.002	-0.005	0.051	0.078
CAD	-0.154	-0.535	-0.323	-0.071	0.086	-0.132	-0.085	-0.278
CCOAMT	0.000	0.000	0.000	0.000	0.031	0.000	0.000	0.000
CCR	-0.080	-0.218	0.081	0.306	0.205	0.027	0.104	-0.130
CCR1	-0.036	-0.119	-0.101	0.048	-0.027	-0.074	-0.163	0.040
CHS	-0.094	-0.392	-0.115	0.258	0.476	0.000	0.327	-0.095
CM1	0.132	0.078	0.448	0.346	0.225	-0.115	0.030	-0.024
COMT	0.151	-0.024	0.348	0.580	0.512	0.120	0.386	0.053
CYP71B6	-0.007	0.000	-0.310	-0.090	0.153	-0.025	-0.188	-0.023
CYP83B1	0.199	0.294	0.481	0.414	0.437	0.007	-0.069	-0.096
CYP93A1	-0.012	-0.107	-0.202	0.025	0.076	-0.007	0.015	-0.080
DBP	0.526	0.557	0.569	0.464	0.302	0.442	0.075	0.163
DHS1	0.015	-0.155	-0.070	-0.078	-0.013	-0.077	-0.021	-0.067
ECS1	0.164	-0.044	0.105	0.081	0.070	0.181	0.117	0.040
EF1	0.011	-0.045	0.025	0.086	0.124	-0.130	-0.001	-0.081
EH	0.051	0.143	0.026	0.176	0.248	0.459	0.006	0.331
EIF4A	-0.011	-0.038	0.134	0.205	0.251	0.078	0.001	-0.240
ELI3	0.068	-0.447	-0.135	0.140	0.445	-0.094	0.012	-0.161
ELI5	0.160	-0.212	-0.046	-0.108	-0.118	-0.228	0.094	-0.200
ELI9	0.169	0.177	0.101	0.155	0.132	0.023	0.253	0.282
ER5	0.618	0.842	0.964	0.924	0.521	0.057	0.138	0.102
EREC	0.144	0.000	-0.222	-0.059	-0.030	-0.195	0.000	-0.106
ERF	0.005	-0.260	-0.301	-0.059	0.262	0.090	-0.159	0.005
ERF4	0.780	0.770	0.759	0.621	0.542	0.268	0.111	0.094
F5H	-0.084	-0.326	-0.244	0.043	0.170	-0.206	0.190	-0.112
FAD2	0.071	-0.018	-0.142	0.039	0.035	-0.087	0.042	0.200
FAD7	0.030	0.052	0.281	0.539	0.364	0.048	-0.079	0.116
FPS1	0.166	-0.164	-0.064	-0.103	-0.053	-0.009	-0.233	-0.255
GER2	0.000	0.000	-0.061	0.000	0.169	0.000	0.000	0.000
GF14	0.073	-0.096	-0.049	0.091	0.190	-0.121	-0.099	0.013
GPX1	0.251	0.090	-0.048	-0.068	-0.019	-0.164	0.125	0.079
GPX2	0.128	0.052	0.013	0.252	0.551	0.189	0.324	0.053
GRP	0.044	0.184	0.008	-0.029	0.213	0.000	0.014	0.000
GS	-0.029	-0.146	-0.284	-0.089	0.198	0.040	-0.158	0.128
GST1	0.351	0.592	0.622	0.813	0.587	0.586	0.304	0.265
GST5	0.234	0.645	0.904	0.800	0.468	0.502	0.191	0.216
GST8	0.087	-0.078	-0.055	0.047	0.323	0.197	0.116	0.100
HADH	0.000	-0.133	-0.234	0.037	0.161	0.056	-0.114	0.182
HCNL1	0.201	0.068	-0.095	-0.061	0.048	-0.075	-0.050	0.026
HCNL2	0.071	0.000	-0.070	0.006	0.055	0.000	0.227	0.097
HEL	0.235	0.210	-0.036	0.048	-0.124	0.102	0.150	0.364
HIN1	0.000	0.000	-0.029	0.000	0.005	0.000	0.000	0.000
HIST	0.019	-0.025	-0.037	-0.070	0.011	-0.205	-0.268	-0.164
HMG1	-0.005	-0.213	-0.124	0.014	0.159	-0.151	-0.111	-0.182
HPL	0.000	0.000	0.760	0.659	0.329	0.828	0.033	0.237
HRGP	0.213	0.318	0.138	0.130	0.063	0.087	0.117	0.076
HSC70	-0.107	-0.148	-0.023	0.192	0.090	-0.121	-0.180	-0.039
JIGT	0.058	-0.120	-0.161	-0.084	0.064	-0.277	0.002	0.244
JIP	0.201	0.000	0.137	0.340	0.919	0.477	0.407	0.266
JR3	0.363	0.679	1.052	0.884	0.653	0.316	0.097	0.131
KNAT1	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000	0.000
LECRK	0.000	0.000	-0.007	0.000	0.177	0.000	0.000	0.000
LOX1	0.035	0.000	-0.129	-0.050	0.061	0.000	0.000	0.238
LOX2	0.109	0.240	0.641	0.428	0.347	0.523	0.139	0.256
MBP	0.000	0.000	-0.017	0.217	0.515	0.461	0.239	0.090
MEKK1	0.328	0.098	-0.068	0.047	0.156	0.007	-0.262	-0.145
MEKKK	0.000	0.000	0.000	0.000	0.253	0.000	0.000	0.000
MFP2	0.000	-0.187	-0.228	-0.011	0.226	0.142	-0.026	0.194
MP2C	0.058	-0.152	-0.138	0.098	0.133	0.051	-0.103	0.110
MPK3	0.852	0.492	0.026	-0.009	0.197	0.008	-0.217	-0.126
MRP2	-0.096	0.000	-0.321	-0.017	0.136	0.000	0.000	-0.022
MT1	0.235	-0.004	0.259	0.442	0.644	0.767	0.566	0.122
MYB68	0.000	0.000	0.000	0.000	0.052	0.000	0.135	0.000
MYOL	0.000	0.000	-0.013	0.000	-0.013	0.000	-0.047	0.000
NDK	-0.001	-0.040	-0.028	0.090	0.260	-0.115	-0.117	0.048
NDR1	0.260	0.072	-0.024	0.001	-0.007	-0.122	-0.272	-0.063
NIT2	-0.020	-0.133	-0.197	0.031	0.407	-0.136	-0.015	-0.066
NPR1	0.000	0.000	-0.020	0.097	0.055	-0.092	0.000	-0.073
NR	-0.029	-0.268	-0.309	-0.105	0.294	0.223	-0.105	-0.017
OEC	-0.018	-0.012	0.181	0.358	0.427	-0.006	-0.048	0.070
OPR1	0.278	0.785	0.804	0.937	0.679	0.553	0.213	0.180
OZI1	0.207	-0.002	0.095	0.220	0.270	0.171	0.139	0.017
PAL	0.136	0.238	0.314	0.544	0.359	0.421	0.302	-0.105
PAL1	-0.206	0.000	0.308	0.659	0.069	0.000	0.218	-0.190
PAL2	-0.147	0.095	0.323	0.629	0.045	0.000	0.174	-0.293
PDF1.2	0.127	0.648	0.012	0.059	-0.026	0.337	0.337	0.971
PED1	0.112	-0.110	-0.213	-0.099	0.229	0.037	-0.108	0.138
PEL	0.298	0.083	-0.111	-0.019	0.047	-0.145	0.052	0.052
PGIP	1.161	1.046	0.973	0.418	0.445	0.364	0.552	0.527
PGK	-0.105	-0.122	-0.026	-0.034	-0.008	0.020	-0.097	-0.099
PIOX	0.000	0.000	0.000	0.000	-0.015	0.000	0.000	0.000
PIR7B	0.014	-0.241	-0.195	-0.123	-0.020	0.010	-0.029	0.042
PLASTO	0.086	-0.045	-0.002	-0.022	0.028	-0.123	-0.071	0.134
PLC1	0.000	0.000	0.027	0.000	0.059	0.000	0.000	0.000
PLC2	0.000	0.000	-0.023	-0.033	-0.004	0.000	0.000	-0.068
PLD	0.014	-0.067	-0.091	-0.052	0.014	-0.036	0.022	0.021
PME1	0.523	0.352	0.409	0.181	0.129	0.049	0.068	-0.049
PR1	0.793	0.015	-0.113	0.055	0.007	0.013	0.547	0.052
PR2	0.411	0.149	0.158	0.463	0.426	0.321	0.370	-0.233
PR3AIII	0.000	0.000	0.008	0.033	0.140	0.000	0.000	0.000
PR3AIV	0.191	0.393	0.561	0.563	0.203	0.323	0.236	0.202
PR3B1	-0.003	0.000	0.000	0.000	0.171	0.000	0.000	0.327
PR5	0.251	-0.018	-0.094	0.097	0.101	-0.088	0.135	-0.455
PRK	-0.017	-0.208	-0.154	-0.235	-0.153	0.087	-0.028	-0.099
PRODH	0.000	0.000	0.723	0.900	0.366	0.334	0.000	0.000
PRX7	0.000	0.000	0.060	0.000	0.005	0.000	0.000	0.000
REM2	0.384	0.166	0.131	0.111	0.201	-0.137	-0.059	0.084
REM3	0.042	-0.412	-0.237	0.000	0.191	-0.217	-0.117	-0.025
REM5	0.088	0.000	0.000	-0.140	0.020	0.000	0.000	-0.181
RNS1	0.000	0.000	0.464	1.680	1.626	1.762	1.927	1.719
RNS2	0.082	0.000	-0.171	0.016	0.171	0.087	-0.227	0.004
ROF1	-0.112	-0.163	-0.114	0.118	0.159	-0.022	-0.116	0.050
RUB	0.021	0.103	0.055	-0.007	0.076	0.031	0.074	0.213
SAHH	-0.171	-0.174	0.004	0.306	0.193	-0.143	-0.130	-0.039
SAM	0.018	0.008	0.062	0.213	0.232	-0.092	-0.062	0.037
SODCU	0.145	0.133	0.241	0.256	0.100	0.056	0.301	0.034
SODFE	0.072	0.002	-0.047	-0.010	0.129	-0.034	0.174	-0.276
SPS	-0.012	-0.116	-0.202	0.114	0.160	0.031	-0.055	0.076
TCH1	0.336	0.298	0.335	0.323	0.339	0.060	-0.139	-0.044
TCH2	0.786	0.773	0.175	0.324	0.425	0.415	-0.196	0.037
TCH3	0.805	0.763	0.444	0.369	0.216	-0.130	-0.051	-0.092
TCH4	0.675	0.546	0.262	0.377	0.679	0.137	-0.113	0.174
TGG1	0.235	0.182	0.065	0.047	0.096	-0.020	0.094	-0.007
TGG2	0.209	0.209	0.084	0.120	0.124	0.087	0.144	0.119
THI2.1	0.094	0.143	0.083	0.097	0.197	-0.071	0.019	-0.081
TSA	0.121	0.062	0.441	0.649	0.675	0.312	0.131	-0.055
TSB	0.018	0.020	0.282	0.392	0.393	-0.061	-0.081	-0.147
TUFA	-0.091	-0.273	-0.137	-0.147	-0.036	-0.133	-0.078	-0.169
UBIQ	0.218	0.045	0.010	0.110	0.068	0.034	0.124	-0.009
XERO2	0.000	0.000	1.649	1.415	1.096	0.619	1.141	0.874

Search:

Directories Site map