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David Gatfield

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Version du:  14.08.17
Par: Caroline Ronzaud /
Communication FBM
 
 

David Gatfield, professeur associé

Spécialiste de l’horloge circadienne et de la biologie des ARNs, David Gatfield explore les mécanismes de régulation des gènes et leurs conséquences au niveau métabolique, physiologique et comportemental. Il a été nommé professeur associé au Centre intégratif de génomique (CIG) de l’UNIL dès le 1er février 2017.

Presque toutes les fonctions biologiques des mammifères sont régulées au cours de la journée par une horloge interne appelée «horloge circadienne». Des dysfonctionnements de celle-ci jouent un rôle dans l'apparition de nombreuses maladies humaines. Comment cette horloge intègre-t-elle les signaux environnementaux? Quels sont les mécanismes moléculaires impliqués dans la communication entre l’horloge et le métabolisme? De quelle manière ce rythme interne est-il régulé au niveau de la traduction et de la stabilité de l'ARN messager (ARNm)? Comment une horloge défectueuse conduit-elle à un état pathologique? Ces questions sont au cœur de la recherche de David Gatfield.

Après une thèse sur la stabilité des ARNm et leur export hors du noyau, le scientifique s’intéresse au rôle des microARNs1 (miARNs) dans la génération des rythmes et montre le lien entre un miARN très abondant dans le foie et la régulation circadienne du métabolisme. C’est au CIG qu’il développe des approches génomiques afin d’étudier le rôle des miARNs dans la rythmicité du transcriptome et du protéome. Par ailleurs, il met en évidence l’importance de la régulation rythmique de la synthèse des protéines par les ribosomes pour le fonctionnement de l’horloge moléculaire. Il identifie également un nouveau mécanisme influençant l’horloge: la traduction des cadres de lecture ouverts2 situés juste en amont des séquences codant pour les protéines («upstream open reading frames» ou uORFs en anglais), dans des parties de transcrits considérées jusqu’alors comme non-traduites.

Dans le cadre de sa nomination, le professeur désire appliquer son expertise, ainsi que les modèles in vivo de mesure des rythmes d’expression génique et les techniques basées sur le séquençage et la bioinformatique qu’il a développés, pour poursuivre ses recherches sur la régulation rythmique de la traduction in vivo. Un des buts de sa recherche consiste à mieux comprendre le rôle régulateur des ribosomes et des uORFs sur le métabolisme, la physiologie et le comportement. Par ailleurs, David Gatfield a pour ambition d'étendre ses recherches au-delà de la problématique des rythmes circadiens, comme la génétique du sommeil et le métabolisme.

Les travaux de recherche de David Gatfield ont été récompensés par plusieurs prix, tels que le Prix Leenaards pour la promotion de la recherche scientifique (2012), des bourses du SNF et sa participation à des consortia de recherche (NCCR, SystemsX.ch). Il a également publié dans des revues scientifiques de référence comme Nature, Cell, Science, Genome Research et Genes & Development. David Gatfield est par ailleurs impliqué dans l’enseignement pré-gradué et a supervisé plusieurs étudiants et doctorants.

1microARNs: courtes molécules d’ARN capables d’extinction de l’expression d’un gène

2Cadre ouvert de lecture : partie de la séquence de l’ARNm délimitée par deux codons stop et susceptible d'encoder une protéine. Le site de terminaison de la transcription est situé après le cadre de lecture ouvert, au-delà du codon stop.

Bio express

1974 Naissance en Allemagne, de nationalités allemande et britannique
2000 Diplôme de Master en biochimie, Eberhard-Karls-Universität Tübingen, Allemagne
2000-2004 Doctorat dans le groupe de la Prof. Elisa Izaurralde, Laboratoire européen de biologie moléculaire (EMBL), Heidelberg, Allemagne
2004-2010 Post-doctorat dans le groupe du Prof. Ueli Schibler, Département de biologie moléculaire, Université de Genève
2010-2017 Professeur assistant boursier du FNS, Centre intégratif de génomique (CIG), UNIL
dès 2017 Professeur associé, Centre intégratif de génomique (CIG), UNIL

 

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