Aller à: contenu | haut | bas | recherche
 
 
Vous êtes iciUNIL > Faculté de biologie et de médecine > Communication > Nouveaux professeurs > 2015 > Dessimoz Christophe

Christophe Dessimoz

dessimoz.jpg
 
Version du:  09.10.15
Par: Communication FBM
 
 

Christophe Dessimoz, professeur assistant boursier FNS

Biologiste et informaticien de formation, Christophe Dessimoz est un spécialiste de génomique comparative. Il s’intéresse à l’histoire phylogénétique des espèces et cherche à comprendre les relations évolutives et fonctionnelles entre les gènes, les génomes et les espèces. Pour ce faire, le scientifique développe la plateforme OMA (Orthology Matrix Algorithm), dont la base de données recense plus de 1800 génomes séquencés. Il est également l’un des coordinateurs du consortium Quest for Orthologs qui vise à optimiser les méthodes et les ressources bioinformatiques pour décrypter les liens entre les gènes. Il mène des travaux sur des sujets aussi divers que les céréales, le furet et les vers marins. Il a été nommé professeur assistant boursier FNS au sein du Département d’écologie et évolution (DEE) et du Centre  intégratif de génomique (CIG) de l’UNIL dès le 1er septembre 2015.

Né en 1980 et de nationalité suisse, Christophe Dessimoz étudie la biologie à l’École polytechnique de Zurich (ETH) avant d’y effectuer son doctorat dans le Département d’Informatique sous la direction du Prof. Gaston Gonnet. En 2009, il poursuit ses travaux en tant que postdoctorant dans le domaine de la bioinformatique et de la génomique comparative (comparaison de génomes de différentes espèces). Muni d’une bourse pour chercheur avancé du Fonds national suisse de la recherche scientifique (FNS), Christophe Dessimoz s’envole en 2011 pour Cambridge (Royaume-Uni), où il rejoint le groupe de Nick Goldman à l’Institut européen de bioinformatique (EBI). En 2013, il obtient un poste de maître de conférences conjointement au Département de génétique, environnement et évolution et à celui d’informatique de l’University College de Londres (UCL). Il monte alors son propre groupe de recherche tout en continuant à travailler à l’EBI comme visiteur scientifique. Au bénéfice d’une bourse FNS, Christophe Dessimoz est nommé professeur assistant aux DEE et CIG de l’UNIL dès le 1er septembre 2015.

Les travaux de recherche de Christophe Dessimoz visent à mieux comprendre les interactions évolutives et fonctionnelles entre les gènes, les génomes et les espèces. Le premier axe de recherche consiste à déterminer comment extrapoler au mieux notre connaissance actuelle en biologie moléculaire, qui se limite à seulement quelques organismes modèles, au reste du vivant. Réciproquement, le deuxième axe vise à identifier la manière d’exploiter la richesse et la diversité du vivant dans le but de mieux comprendre la biologie humaine et les maladies. Enfin, le troisième axe a pour objectif d’établir s’il est possible de résumer de manière judicieuse et en seulement quelques arborescences l’évolution des espèces. Pour répondre à ces questions, Christophe Dessimoz développe des outils statistiques et bioinformatiques et les applique à grande échelle sur les données génomiques. Ces méthodes permettent notamment d’identifier les gènes ancestraux et de modéliser les liens évolutifs entre deux gènes de deux espèces différentes. Les outils et ressources mis en place dans son laboratoire, notamment la base de données OMA qui crée des liens entre les génomes de milliers d’espèces, sont employés par des milliers de chercheurs provenant du monde académique ou industriel. Le chercheur développe également des moyens pour évaluer et mieux structurer les outils d’annotation et de description des gènes et de leurs produits.

Le travail de Christophe Dessimoz a été plusieurs fois récompensé : le scientifique compte notamment à son palmarès une distinction de l’Institut suisse de bioinformatique (SIB) (2012), deux financements de Bayer CropScience NV (2013 et 2014), une bourse de l’UCL (2013) et deux du Biotechnology and Biological Sciences Research Council britannique (2014).

Le chercheur a également publié près de 50 articles dans de nombreuses revues scientifiques de référence telles que :

  • Nature (2013),
  • Nature Biotechnology (2015),
  • PNAS (2015),
  • Systematic Biology (2011, 2015),
  • Genome Biology (2009, 2010),
  • Trends in Genetics (2014),
  • PLOS Computational Biology (2009, 2012, 2015),
  • Nucleic Acids Research (2006, 2009, 2011, 2015).

Le jeune professeur est par ailleurs très impliqué dans l’enseignement: il a conçu et donné des cours à l’ETH, à l’Université de Cambridge et à l’UCL. Il a également supervisé six étudiants en thèse et plus d’une trentaine d’étudiants en Bachelor et Master.

 

Les liens:
L'entretien du  mois: Christophe Dessimoz, février 2016

 

Recherche:
 Go
 
rss/atom
youtube 
Rue du Bugnon 21 - CH-1011 Lausanne  - Suisse  -  Tél. +41 21 692 50 00  -  Fax +41 21 692 50 05
Swiss University