Le Musée possède à Dorigny plusieurs ateliers tant pour la préparation des roches que pour la préparation d'exposition.
- Un atelier de nettoyage, sciage et de ponçage de roche.
- Un atelier de dégagement de fossiles avec une sableuse.
- Un atelier de menuiserie.
- Un atelier de travaux sur métaux.
De plus, au Palais de Rumine, un petit atelier sert au montage des expositions.
