COVID19 & OS

Open Science COVID-19 | Open Acess COVID-19 | Open Data COVID-19 | Médias & Presse
 

Open Science COVID-19

Task Force nationale COVID-19

La Swiss National COVID-19 Science Task Force agit, sur mandat de plusieurs services de la Confédération, au titre de comité consultatif scientifique national dans le cadre de la pandémie de COVID-19 (Site officiel).

SPARC Europe reads and Open use cases

As many of us find ourselves working from home we would like to suggest some pertinent reading connecting work on Open Science with COVID-19. Scores of blog posts and articles which demonstrate the value of Open at this time are being written (more).

An MIT team hopes to publish open-source designs for a low-cost ventilator

"The researchers hope that those with manufacturing capacity and medical expertise can accelerate production of the critical medical devices."
(James Temple, MIT Technology Review, 24.03.2020)

COVID-19 Open-Source Help Desk

We are expert users, developers, maintainers and community leaders of major open source scientific computing software packages used across scientific fields, and we want to help you ! (more)

Folding@home : donate computer power !

We’re simulating the dynamics of COVID-19 proteins to hunt for new therapeutic opportunities. [...] Downloading Folding@home and helping us run simulations is the primary way to contribute.

Open Acess COVID-19

Ressource BCUL – Bibliothèque cantonale et universitaire de Lausanne

  • Ressources supplémentaires pour les étudiants et enseignants en période de COVID-19 : contenus en OA, classés par éditeur, et non couverts par nos licences courantes
  • Ressources en lien avec le COVID-19 : plateformes dédiées au COVID19 et aux pandémies récemment créées par les éditeurs

Liste des ressources Bibliothèque de l'EPFL

Liste non exhaustive des ressources utiles, temporairement disponibles gratuitement ou déjà abonnées par la Bibliothèque de l'EPFL (plus).

Swissuniversities : Appel aux éditeurs scientifiques « Ouvrez l’accès aux publications scientifiques pour s'assurer la recherche sur Covid-19! »

Swissuniversities, le Fonds national suisse et le Consortium des bibliothèques universitaires suisses font l’appel aux éditeurs académiques : "Ouvrez l’accès aux publications scientifiques !"

Avec le Consortium des bibliothèques universitaires suisses, swissuniversities et le Fonds national suisse de la recherche scientifique se joignent au communiqué de la coalition internationale ICOLC et demandent aux éditeurs scientifiques d’ouvrir, dans ces circonstances exceptionnelles, leurs publications à tous, afin de faire face, unis, à une crise sanitaire mondiale sans précédent. La pandémie de Covid-19 actuelle rend évidente la nécessité de l’ouverture globale des publications, trop souvent soumises à des abonnements payants. (Newsletter 25.03.2020)

La Bibliothèque Solidaire du confinement #BiblioSolidaire

Partagez une publication pour demander si une personne a la référence donc vous avez besoin, et cette personne pourra vous l’envoyer par message privé. Certains membres postent aussi le contenu de leurs bibliothèques, vous pouvez les contacter via le groupe pour avoir accès à certains ouvrages. Voir groupes Facebook et Zotero.

JSTOR resources during COVID-19

To support our institutions during this challenging time, JSTOR and our participating publishers are making an expanded set of content freely available to our participating institutions where students have been displaced due to COVID-19. (More)

Open Data COVID-19

L’expansion du nouveau coronavirus en Suisse

Cartes interactives : Labs.letemps.ch

RDA COVID-19; Recommendations and guidelines 1st release - open for comments

In response to a direct request from the European Commission, one of the RDA [Resarch Data Alliance] funding agencies, the RDA community answered a call to action at the end of March 2020 and set up an RDA Working group, with 5 sub-groups focusing on essential thematic areas: Clinical, Community Participation, Epidemiology, Omics, and Social Sciences (more).

Nextstrain Project : Genomic epidemiology of novel coronavirus

Nextstrain is an open-source project to harness the scientific and public health potential of pathogen genome data. We provide a continually-updated view of publicly available data alongside powerful analytic and visualization tools for use by the community. Our goal is to aid epidemiological understanding and improve outbreak response (more).

OECD Call for Evidence : Use of Open Government Data in COVID-19 Outbreak

OECDgov's #DigitalGov #OpenData team are looking for examples on how open data are being applied to support governments’ policies & actions to manage this crisis. (more)

VersusVirus online Hackathon (3-5.4.2020)

48 heures. Vous et potentiellement 8 millions d'autres participant·e·s. La crise Covid-19 en Suisse. En Europe. Dans le monde entier. Nous sommes solidaires. Nous trouvons des solutions ! Soyez là avec vos compétences pour relever les défis dès maintenant - quel que soit votre parcours. Participez ! (more)

GISAID : Permettre un accès rapide et ouvert aux données sur les virus épidémiques et pandémiques

L'initiative GISAID encourage le partage rapide des données relatives à tous les virus de la grippe et au coronavirus responsable de la COVID-19. Cela comprend la séquence génétique et les données cliniques et épidémiologiques associées aux virus humains, ainsi que les données géographiques et spécifiques aux espèces associées aux virus aviaires et autres virus animaux, afin d'aider les chercheurs à comprendre comment les virus évoluent et se propagent au cours des épidémies et des pandémies. (more)

Médias & Presse

Open science takes on the coronavirus pandemic

"Data sharing, open-source designs for medical equipment, and hobbyists are all being harnessed to combat COVID-19."
(Mark Zastrow, Nature, 24.04.2020)

Coronavirus Is Forcing Medical Research to Speed Up

"As scientists race to understand the coronavirus, the process of designing experiments, collecting data and submitting studies to journals for expert review is being compressed drastically."
(

Covid-19 : How unprecedented data sharing has led to faster-than-ever outbreak research

"Advances in gene sequencing have allowed scientists to trace and monitor the COVID-19 pandemic faster than any previous outbreak. However, gaps in our knowledge of how coronaviruses work has made it difficult to understand what makes the new coronavirus special."
(Horizon : The EU Research & Innovation Magazine, 23.03.2020)

How Open Science and Open Data can help in the fight against COVID-19

"With the global Novel Coronavirus pandemic filling headlines, TV news space and social media it can seem as if we are drowning in information and data about the virus.  With so much data being pushed at us and shared it can be hard for the general public to know what is correct, what is useful and (unfortunately) what is dangerous. Thankfully though, scientists around the world working on COVID-19 are able to work together, share data and findings and hopefully make a difference to the containment, treatment and eventually vaccines for COVID-19."
(GÉANT, Connect Magazine)

So schnell war die Wissenschaft noch nie zuvor

[Jamais auparavant la science n'avait été aussi rapide] "La lutte contre le coronavirus entraîne un changement radical dans la science. Les chercheurs partagent leurs données, travaillent plus rapidement que jamais et s’adressent au public par le biais des médias sociaux."
(Martin Amrein, NZZ am Sonntag, 22.03.2020, disponible via la plateforme Synopsis de l'UNIL)

Un doctorant bernois propose un outil open source pour suivre les chiffres du coronavirus en Suisse

"Alors que la colère monte contre le manque de transparence des chiffres de l'épidémie de coronavirus en Suisse, un jeune chercheur a programmé un agrégateur en quelques heures. Tout est gratuit: des données au code en passant par cet article tant ces données sont importantes pour bien réagir face à l'épidémie et mieux la comprendre."
(Annick Chevillot, Heidi.news, 22.03.2020)

A completely new culture of doing research

Coronavirus outbreak changes how scientists communicate.
(Kai Kupferschmidt, Science Magazine, 26.02.2020)

 

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COVID-19 Cases Switzerland

Cantonal COVID-19 case numbers

Make all official Cantonal COVID-19 case numbers available :

--> Datas on Github | Data Visualization | Project

ETH Domain COVID-19 Task Force

Switzerland, as many countries worldwide, is facing a huge healthcare crisis. The country, but also our institutions, are challenged to find the best approach to address the current pandemic (more).

COVID-19 European Data Portal

An overview of COVID-19 and the available open datasets on the European Data Portal and beyond (more).

COVID-19 Research Collection

Le Center for Open Science a récemment lancé une Collection ouverte et accessible des recherches menées sur le SRAS-CoV2/COVID-19.

Cette collection permet de partager des données, des modèles et des résultats en temps réel.

Soutien CHUV

Pour adresser un message de soutien, proposer son aide, se porter volontaire (soignant·e·s, bénévoles), rdv ici !

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