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Les ouvrages suivants, édités par le musée et qui peuvent être commandés à son secrétariat, sont des travaux scientifiques qui s'adressent à un public de professionnels:
- Micropaleontology of some Permian localities in the Tethyan realm: Inventory of foraminifers and calcareous algae, biostratigraphy and paleogeography. By Catherine Jenny with Jean Guex, Gérard Stampfli and Sylvain Richoz, 2009.
- Catalogue des types paléontologiques déposés au Musée cantonal de Géologie, Lausanne: Ce catalogue des types et les index qui lui sont associés recense toute la collection paléontologique du musée. Par Michel Septfontaine, 1995.
- Constraints on the Upper Permian to Upper Triassic marine carbon isotope curve: Case studies from the Tethys. PhD Thesis. By Nicu-Viorel Atudorei, 1998 (épuisé - out of print).
Pour nos autres publications scientifiques qui ne sont pas publiées par le musée, consulter les pages personnelles de l'équipe du musée.